Como a comunidade nasceu de um grupo de oração do movimento da Renovação Carismática Católica, a espiritualidade dos membros é baseada na busca contínua da efusão do Espírito Santo e no uso dos carismas. A palavra significante, do carisma da comunidade, é o texto do evangelho de São João (Jo 3,3-8).

O nascer de novo envolve a vida dos consagrados, para que, por meio deles, todos desejem essa renovação de vida pelo espírito.

Expresso em seu próprio nome, a Comunidade Missão Maria de Nazaré apresenta sua referência maior em Maria Santíssima. Portanto, possui também uma espiritualidade mariana.